O prefeito eleito de São Paulo, José Serra (PSDB), derrotou a atual prefeita Marta Suplicy, que disputava a reeleição, por 54,99% (3.313.092) contra 45,01% de votos (2.711.434).
Com a eleição de Serra, o PSDB passará a administrar a maior cidade do país com 7,7 milhões de eleitores e uma população de 10,8 milhões de habitantes. Serra também irá administrar um dos maiores orçamentos do país pelos próximos quatro anos.
José Serra, que nasceu na capital paulista, iniciou sua carreira política no movimento estudantil. Foi presidente da UNE (União Nacional dos Estudantes) em 1963. Com o golpe militar de 64, exilou-se na Bolívia, Chile, Itália e Estados Unidos. Serra retornou ao Brasil em 1978, quando assumiu a secretaria de Economia e Planejamento do Estado no governo Franco Montoro. Elegeu-se deputado federal em 1986 e 1990 e senador em 1994.
Foi ministro do Planejamento no primeiro governo Fernando Henrique Cardoso. Em 96, deixou o ministério do Planejamento para disputar a prefeitura de São Paulo, quando foi derrotado pelo aliado do então prefeito Paulo Maluf, Celso Pitta. No segundo governo FHC, José Serra assumiu o Ministério da Saúde.
Entre as propostas de Serra para a educação estão ampliar as vagas em creches e pré-escolas para atender a 150 mil crianças, ampliar a carga horária para cinco horas no ensino fundamental. Na área da saúde, o candidato pretende recuperar postos de saúde, investindo em médicos, atendentes e equipamentos, e criar postos de saúde 24 horas.
Serra deve deixar a presidência do PSDB porque o cargo não pode ser exercido por alguém com mandato no Executivo.